Oczyszczanie przeciwciał metodą chromatografii powinowactwa.
Procedura oczyszczania przeciwciał metodą chromatografii powinowactwa obejmuje następujące etapy:
- Aktywacja złoża
- Przyłączenie ligandu (w tym wypadku specyficznego do przeciwciał antygenu) do kolumny
- Opłukanie niezwiązanego z kolumną ligandu i wysycenie pozostałych aktywnych miejsc na kolumnie
- Zrównoważenie kolumny, naniesienie surowicy i inkubacja kolumny z surowicą
- Odpłukanie niezwiązanych cząsteczek
- Elucja swoistych przeciwciał
Aktywacja złoża, wiązanie ligandu i wysycanie pozostałych aktywnych miejsc na kolumnie.
- Na kolumnę z odpowiednim złożem (np. agaroza, sefadex, ...) łączy się ligand poprzez grupy ~SH. Białko powinno zawierać więcej niż 50% wolnych grup SH. Jeśli jest mniej należy białko zredukować (np. MET) w celu zwiększenia zawartości wolnych grup SH.
- Wybrane złoże doprowadzić do temperatury pokojowej i zrównoważyć buforem, który będzie użyty do łączenia z ligandem (bufor do łączenia).
- Nanieść roztwór ligandu w buforze do łączenia. Używać około 1ml roztworu na 1ml żelu. Pozostawić niewielką ilość roztworu do pomiaru ilości białka.
- Inkubacja 15 minut w temperaturze pokojowej z delikatnym mieszaniem zawartości kolumny. Po czym inkubacja godzinę bez mieszania.
- Przemyć kolumnę buforem użytym do łączenia ligandu (około 3 objętościami kolumny). Wyciek z kolumny i ostatnie płukanie zachować do pomiaru białka.
- Zmierzyć ilość białka z punktu nr 2 (w celu sprawdzenia efektywności wiązania ligandu), 4 i 5 przy długości fali 280 nm.
- Nanieś bufor do wysycania kolumny na każdy 1 ml kolumny 1 ml buforu.
- 15 minut delikatnie mieszać zawartość kolumny w temperaturze pokojowej a następnie inkubować jeszcze godzinę w temperaturze pokojowej bez mieszania.
- Przemyć kolumnę buforem do przemywania (około 6 objętości kolumny) a następnie buforem do przechowywania kolumny (około 2 objętości kolumny).
- Przechować kolumnę związaną z ligandem w buforze do przechowywania kolumny w objętości około 2 ml buforu ponad złoże w temperaturze 4°C.
Oczyszczanie przeciwciał na kolumnie powinowactwa
- Kolumnę z antygenem związanym ze złożem oraz używane bufory doprowadzić do temperatury pokojowej w celu uniknięcia wnikania pęcherzyków powietrza w żel.
- Zrównoważyć kolumnę PBS (około 3 objętościami kolumny) lub innym buforem w którym rozpuszczona jest próba poddawana oczyszczaniu.
- Nanieść surowicę rozcieńczoną 1:1 PBS i inkubować godzinę w temperaturze pokojowej.
- Odpłukać PBS-em niezwiązane z kolumną białka (około 3 objetościami kolumny).
- Swoiste przeciwciała (związane z peptydami) eluować 0,1M roztworem glicyny o pH 2,4 (w jednomililitrowych frakcjach) do probówek zawirajacych 50µl 1M TRIS, pH9 lub 100 µl 1M Tris, pH 7.5 (neutralizacja niskiego pH buforu do elucji).
- Ilość białka w poszczególnych frakcjach mierzyć spektrofotometrycznie przy długości fali 280 nm.
- Otrzymane po oczyszczeniu frakcje zawierają przeciwciała skierowane przeciwko peptydom użytym do immunizacji zwierząt.
- Stężenie przeciwciał we frakcjach można obliczyć posługując się następującą proporcją: 1 OD280 = 0,75 mg/ml.
Regeneracja i przechowywanie kolumny:
- Przemyć kolumnę PBS jak najszybciej po zakończeniu eucji (około 8 objetosciami kolumny). (Szybkie przemycie kolumny jest ważne w celu ochrony, przez działaniem niskiego pH buforu elucyjnego na związany z kolumną ligand).
- Przemyć kolumnę buforem do przechowywania kolumny (około 4 objętościami kolumny).
- Nanieść około 2ml buforu do przechowywania kolumny na górę żelu i przechowywać kolumnę w temperaturze 4°C.
- bufor do łączenia ligandu
- 50 mM Tris
- 5mM EDTA-Na, pH 8,5
- bufor do wysycania kolumny
- 5050mM L-cysteina-HCL w buforze do łączenia ligandu
- bufor do przemywania kolumny
- 1M NaCl
- 50 mM Tris
- bufor do elucji z kolumny
- 0,1M roztwór glicyny o pH 2,4
- bufor do przechowywania kolumny
- PBS (0,1M KH2PO4, 0,1M Na2HPO4x7H2O, 0,15M NaCl)
- 0,05% NaN3
Przejdź do: chromatografia powinowactwa
Autor: dr Joanna Skubis-Zegadło

